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Enlaces Web NCBI

El National Center for Biotechnology Information (NCBI) de la National Library of Medicine mantiene varias bases de datos con información sobre secuencias genéticas. En MEDLINE^® se puede vincular un registro completo a cualquiera de las diez bases de datos.

Haga clic en el enlace Web para obtener información sobre los datos de secuencias genéticas reportados en el registro fuente.

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Conserved Domains

Conserved Domains es una base de datos de dominios de proteínas. Las bases de datos fuente de Conserved Domains son Pfam, Smart y COG*.

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Base de datos Genome

La base de datos Genome ofrece vistas de una gran variedad de genomas, cromosomas completos y mapas de secuencias con contigs, así como mapas físicos y genéticos integrados. La base de datos está organizada en seis grupos de organismos principales: arqueas, bacterias, eucariontes, virus, viroides y plásmidos, e incluye plásmidos, orgánulos y cromosomas completos, así como esquemas de conjuntos de genomas*.

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Nucleotide

La base de datos Nucleotide contiene datos de secuencias de las bases de datos GenBank, EMBL y DDBJ, los miembros de la colaboración internacional y tripartita de bases de datos de secuencias. El EMBL es el Laboratorio Europeo de Biología Molecular, que se encuentra en Hinxton Hall (Reino Unido) y el DDBJ es la base de datos de ADN de Japón, que se encuentra en Mishima (Japón). También se incorporan datos de secuencias procedentes de la base de datos Genome Sequence Data Base (GSDB) de Santa Fe (Nuevo México, EE. UU.). Las secuencias de patentes se incorporan a través de acuerdos con la Oficina de Patentes y Marcas de Estados Unidos (USPTO) y mediante las bases de datos colaboradoras de otras oficinas de patentes internacionales*.

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Base de datos OMIM

OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man) es una base de datos de trastornos genéticos y genes humanos creada y editada por el Dr. Victor A. McKusick y sus colegas de la Universidad Johns Hopkins y de otros lugares. El NCBI creó la versión en línea de esta base de datos.

La base de datos contiene información textual y referencias. También incluye numerosos enlaces Web a MEDLINE y registros de secuencias del sistema Entrez, así como enlaces Web a recursos relacionados adicionales en el NCBI y en otras fuentes*.

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Base de datos PopSet

La base de datos PopSet contiene secuencias alineadas enviadas como un conjunto resultante de un estudio filogenético, de población o de mutación. Estas alineaciones describen estos eventos como una variación de la evolución y de la población. La base de datos PopSet contiene información sobre secuencias de proteínas y nucleótidos*.

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ProbeSet

Probe es un registro público de reactivos de ácido nucleico diseñado para su uso en una amplia gama de aplicaciones de investigación biomédica. También incluye información sobre distribuidores de reactivos, efectividad de investigación y similitudes de secuencias computarizadas*.

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Base de datos Protein

La base de datos Protein contiene datos de secuencias de las regiones de codificación traducidas de secuencias de ADN incluidas en las bases de datos GenBank, EMBL y DDBJ, así como secuencias de proteínas enviadas a fuentes como Protein Information Resource (PIR), SWISS-PROT, Protein Research Foundation (PRF) y Protein Data Bank (PDB) (secuencias de estructuras resueltas)*.

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SNP

La base de datos Single Nucleotide Polymorphism Database (dbSNP) es una base de datos y un repositorio central que incluye sustituciones de un solo nucleótido y polimorfismos de pequeñas inserciones y deleciones*.

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Structure

La base de datos Structure o Molecular Modeling Database (MMDB) contiene datos experimentales de determinaciones de estructuras cristalográficas o por resonancia magnética nuclear. Los datos de la MMDB se obtienen de la base de datos Protein Data Bank (PDB). El NCBI ha combinado datos estructurales con información bibliográfica, bases de datos de secuencias y la taxonomía del NCBI*.

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Base de datos Taxonomy

La base de datos Taxonomy contiene los nombres de todos los organismos que están representados en la base de datos genéticos del NCBI por al menos una secuencia de proteínas o nucleótidos*.

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UniGene

La base de datos UniGene incluye agrupaciones génicas de secuencias de transcripciones.

UniGene es un sistema experimental para dividir de forma automática secuencias de GenBank en conjuntos no redundantes de agrupaciones génicas. Cada agrupación de UniGene contiene secuencias que representan un gen único, así como información relacionada como, por ejemplo, los tipos de tejido en los que se expresó el gen y la ubicación en un mapa*.

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UniSTS

La base de datos UniSTS contiene sitios de secuencia identificada (Sequence Tagged Sites, STS) derivados de los datos de mapas de STS.

UniSTS integra datos de mapas y marcadores de numerosos recursos públicos. Asimismo, incluye fuentes de datos como dbSTS, RHdb y GDB, así como diversos mapas humanos y mapas de ratones*.

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Información sobre...

Para obtener más información sobre las bases de datos del NCBI, acceda al sitio web del NCBI.