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NCBI 連結

National Library of Medicine 的 National Center for Biotechnology Information (NCBI) 維護多個基因序列資料的資料庫。MEDLINE® 中的「完整記錄」可連結至十個資料庫之中的任何一個。

按一下連結可取得來源記錄中提及之基因序列資料的相關資訊。

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Conserved Domains

Conserved Domains 是蛋白質功能域的資料庫。Conserved Domains 的來源資料庫是 Pfam、Smart 和 COG。*

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Genome 資料庫

Genome 資料庫提供基因體、完整染色體、contig 序列圖譜、以及整合的遺傳和物理圖譜的各種檢視。資料庫依六大生物分類組織:古菌、細菌、真核生物、病毒、類病毒、質體,並包含完整染色體、胞器、質體以及基因體組序草稿。*

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Nucleotide

Nucleotide 資料庫包含來自 GenBank、EMBL、DDBJ 的序列資料、前述三者的成員、序列資料庫的國際合作。EMBL 是 European Molecular Biology Laboratory (歐洲分子生物學實驗室),位於英國 Hinxton Hall;DDBJ 是 DNA Database of Japan (日本基因庫),位於日本 Mishima。序列資料也與位於美國新墨西哥州 Santa Fe 的 Genome Sequence Data Base (GSDB) 合作。專利序列則與 USPTO (U.S. Patent and Trademark Office,美國專利商標局) 以及與其他國際專利機構的國際資料庫合作。*

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OIMM 資料庫

OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man) 是人類遺傳與遺傳性疾病的資料庫,由 Johns Hopkins University 的 Dr. Victor A. McKusick 及其同事共同編撰。由 NCBI 發展為網路版。

資料庫上有本文資訊和參考文獻。其中包含大量連結,連至 MEDLINE 和 Entrez 系統中的序列記錄。也包含 NCBI 其他相關資源的連結以及其他連結。*

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PopSet 資料庫

PopSet 資料庫有依族群、演化或突變研究的結果集提交的比對序列。這些比對描述演化和族群變異一類的事件。PopSet 資料庫中有核苷酸和蛋白質的序列資料。*

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ProbeSet

Probe 是公開登錄庫,存放用於各式各樣生醫研究應用的核酸試劑,也提供試劑經銷商資訊、探頭效率、計算的序列相似性。*

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Protein 資料庫

Protein 資料庫包含 GenBank、EMBL、DDBJ 中 DNA 序列的轉譯編碼區段的序列資料,以及提交至 Protein Information Resource (PIR)、SWISS-PROT、Protein Research Foundation (PRF)、Protein Data Bank (PDB) 的蛋白質序列 (解出之結構的序列)。*

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SNP

Single Nucleotide Polymorphism Database (dbSNP) 是單鹼基核苷酸取代以及短臂刪除和插入多形性的集中 Repository 資料庫。*

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Structure

Structure 資料庫又稱為 Molecular Modeling Database (MMDB),包含結晶和 NMR 結構測定的實驗資料。MMDB 的資料取自 Protein Data Bank (PDB)。NCBI 已將結構資料交叉連結至書目資訊、序列資料庫和 NCBI 分類。*

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Taxonomy 資料庫

Taxonomy (分類) 資料庫包含 NCBI 基因資料庫中至少呈現一個核苷酸或蛋白質序列的所有生物的名稱。*

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UniGene

UniGene 資料庫包含轉錄序列的基因導向基因串。

UniGene 是實驗性系統,將 GenBank 序列自動分割為基因導向基因串的非多餘序列集。每個 UniGene 基因串包含的序列代表獨一無二的基因以及相關的資訊,如基因表現的組織種類、圖譜位置。*

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UniSTS

UniSTS 資料庫包含由 STS 定位資料衍生的 Sequence Tagged Site (序列標誌點,STS)。

UniSTS 整合各式各樣公開資源上的標記及定位資料。資料來源包括 dbSTS、RHdb、GDB、各種人類圖譜和各種老鼠圖譜。*

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相關資訊

如需 NCBI 資料庫的詳細資訊,請造訪 NCBI 網站