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Links NCBI

O National Center for Biotechnology Information (NCBI) na National Library of Medicine mantém várias bases de dados de sequência genética. Um registro completo na MEDLINE^® pode ser vinculado a qualquer uma das dez bases de dados.

Clique no link para obter informações sobre os dados de sequência genética relatados no registro fonte.

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Conserved Domains

O Conserved Domains é uma base de dados de domínios de proteína. As bases de dados de origem do Conserved Domains são Pfam, Smart e COG.*

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Base de dados Genome

A base de dados Genome fornece exibições de uma variedade de genomas, cromossomos completos, mapas de sequenciamento com contigs e mapas genéticos e físicos integrados. A base de dados é organizada em seis grandes grupos de organismos: Arqueias, bactérias, eucariotos, vírus, viroides e plasmídeos e inclui cromossomos completos, organelas e plasmídeos, bem como rascunhos de conjuntos de genoma.*

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Nucleotide

A base de dados Nucleotide contém dados de sequência da GenBank, EMBL e DDBJ, os membros da colaboração tripartite internacional de bases de dados de sequências. EMBL é o European Molecular Biology Laboratory em Hinxton Hall, Reino Unido; DDBJ é a DNA Database of Japan em Mishima, Japão. Os dados de sequência também foram incorporados da Genome Sequence Data Base (GSDB), Santa Fé, Novo México. As sequências de patente foram incorporadas por meio de acordos com o U.S. Patent and Trademark Office (USPTO) e pela colaboração de bases de dados internacionais de outros escritórios de patentes internacionais.*

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Base de dados OIMM

A OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man) é uma base de dados de genes humanos e distúrbios genéticos de autoria de e editada por Dr. Victor A. McKusick e seus colegas da Universidade Johns Hopkins e outros locais. Ela foi desenvolvida para a Internet pelo NCBI.

A base de dados contém informações textuais e referências. Ela contém diversos links para o MEDLINE e registros de sequência no sistema Entrez. Ela também contém links para recursos relacionados adicionais no NCBI e outros lugares.*

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Base de dados PopSet

A base de dados PopSet contém sequências alinhadas enviadas como resultados de um estudo de mutação, filogenético ou populacional. Esses alinhamentos descrevem esses eventos como evolução e variação populacional. A base de dados PopSet contém dados de sequência de nucleotídeos e de proteínas.*

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ProbeSet

O Probe é um registro público de reagentes de ácido nucleico projetado para ser usado em uma grande variedade de aplicações de pesquisas biomédicas, juntamente com informações sobre distribuidores de reagentes, eficácia de sondas e semelhanças de sequências computadas.*

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Base de dados Protein

A base de dados Protein contém dados de sequência das regiões de código convertido de sequências de DNA no GenBank, EMBL e DDBJ, bem como sequências de proteínas enviadas ao Protein Information Resource (PIR), SWISS-PROT, Protein Research Foundation (PRF) e Protein Data Bank (PDB) (sequências de estruturas resolvidas).*

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SNP

A Single Nucleotide Polymorphism Database (dbSNP) é uma base de dados de repositórios central tanto para substituições e eliminação curta de nucleotídeos de base única quanto polimorfismos de inserção.*

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Estrutura

A base de dados Structure ou Molecular Modeling Database (MMDB) contém dados experimentais de determinações de estrutura NMR e cristalográfica. Os dados da MMDB são obtidos do Protein Data Bank (PDB). O NCBI possui dados estruturais de vínculos cruzados com informações bibliográficas, com as bases de dados de sequência e com taxonomia do NCBI.*

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Base de dados Taxonomy

A base de dados Taxonomy contém os nomes de todos os organismos representados na base de dados genética do NCBI por pelo menos uma sequência de proteína ou de nucleotídeo.*

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UniGene

A base de dados UniGene contém conjuntos relacionados a genes de sequências transcritas.

O UniGene é um sistema experimental para o particionamento automático de sequências do GenBank em um conjunto não redundante de agrupamentos orientados a genes. Cada agrupamento do UniGene contém sequências que representam um gene único, bem como informações relacionadas, como os tipos de tecido nos quais o gene foi expresso e local no mapa.*

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UniSTS

A base de dados UniSTS contém Sequence Tagged Sites (STS) derivados de mapeamentos de dados STS.

A UniSTS integra dados de marcação e mapeamento de vários recursos públicos. As fontes de dados incluem dbSTS, RHdb, GDB, vários mapas humanos e vários mapas de ratos.*

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Informações sobre...

Para obter mais informações sobre as bases de dados NCBI, acesse o site NCBI.